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SNP分型
來源：萬物生物 發(fā)布時間：2021-11-02
SNP介紹
單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），即指由于單個核苷酸堿基的改變而導致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個體的同一條染色體或同一位點的核苷酸序列中，絕大多數(shù)核苷酸序列一致而只有一個堿基不同的現(xiàn)象，這就是SNP。由于SNP在人類基因組中數(shù)量較多，發(fā)生頻率較高，因此被認為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學標記，在醫(yī)學遺傳學、藥物遺傳學、疾病遺傳學、疾病診斷學、以及人類進化等研究領域都有著很高的研究價值和應用前景。
SNP檢測技術(shù)介紹及比較：
質(zhì)譜分析法（mass spectrometry）
該方法利用質(zhì)譜分析對質(zhì)量的靈敏度特別高的特點,很容易將僅含有一個不同堿基的兩段基因序列區(qū)別開的特點,使用質(zhì)譜直接或間接檢測等位基因特異性延伸區(qū)的反應產(chǎn)物,推導出SNP。單堿基延伸或其修飾形式與基質(zhì)輔助激光吸收/離子飛行時間(MALDI-TOF)質(zhì)譜結(jié)合已被廣泛的應用,并已被美國公司(Sequenom)發(fā)展為商業(yè)性產(chǎn)品。我公司提供的SNP檢測技術(shù)服務，就是基于這樣的方法。
DNA芯片技術(shù)（DNA chip）
將已知序列的寡核苷酸DNA排列在1塊集成電路板上，將熒光標記的正常DNA和突變DNA發(fā)別與2塊DNA芯片雜交，由于至少存在1個堿基的差異，正常和突變的DNA將會得到不同的雜交圖譜，經(jīng)過共聚集顯微鏡檢測兩種DNA分子產(chǎn)生的熒光信號，確定是否存在突變。
限制性片段長度多態(tài)性分析法(RFLP)
RFLP技術(shù)利用限制性核酸內(nèi)切酶識別并剪切特定DNA序列的能力,檢測基因片段上限制性核酸內(nèi)切酶識別位點處是否存在核苷酸突變。應用限制性內(nèi)切酶對兩個等位基因識別的差異,產(chǎn)生不同大小的切割片段,通過電泳遷移率的不同來判定是否存在SNP。
實時熒光PCR分析法
使用針對核酸中不同多態(tài)性序列的熒光Taqman探針，它們在PCR擴增中被水解釋放熒光信號，只有與靶序列完全匹配的探針才能被相應的切割。不同探針標記不同的熒光報道信號。利用多通道熒光PCR儀檢測結(jié)果，可以便捷判斷核酸多態(tài)性。
單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法（SSCP）
在非變性聚丙烯酰胺凝膠上，短的單鏈DNA和RNA分子依其大堿基序列不同而形成不同構(gòu)象，一個堿基的改變將影響其構(gòu)象而導致其在凝膠上的移動速度改變。
DNA測序法（DNA sequencing）
雙脫氧終止法，引物用四種不同前顏色的熒光標記，使每個樣品的四個測序反應可在一個反應管和一個泳道內(nèi)進行。
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